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Part Description

LP262505-3   Escherichia coli enteroaggregative astA gene
Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) is a bacteria that causes chronic diarrhea in travelers, children in developing countries, HIV-infected patients, and in farm animals, most commonly piglets and calves. A low-molecular weight, heat-stable, plasmid-encoded enterotoxin known as EAEC heat-stable enterotoxin 1 (EAST1) is produced by some strains of EAEC. EAST1 is encoded by the astA gene. In addition to EAEC, the astA gene has been identified in other diarrheagenic Escherichia coli (EC) pathotypes including enterohemorrhagic E. coli (EHEC), enterotoxigenic E. coli (ETEC), diffusely adherent E. coli (DAEC) and enteropathogenic E. coli (EPEC). PMID: 8385356 PMID: 12003040 Source: Regenstrief LOINC

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Fully-Specified Name
Escherichia coli enteroaggregative astA gene:PrThr:Pt:Isolate:Ord:Probe.amp.tar
Long Common Name
Escherichia coli enteroaggregative astA gene [Presence] in Isolate by NAA with probe detection
Short Name
EAEC astA gene Islt Ql NAA+probe
Display Name
E. coli enteroaggregative astA gene NAA+probe Ql (Isol)
Consumer Name Alpha Get Info
Escherichia coli enteroaggregative astA gene

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  • Component
    Escherichia coli enteroaggregative astA gene
    LP262505-3
    • Analyte
      Escherichia coli enteroaggregative astA gene
      LP262505-3
      • Component Numerator
        Escherichia coli enteroaggregative astA gene
        LP262505-3
        • Component Numerator Core
          Escherichia coli enteroaggregative astA gene
          LP262505-3
        • Component Numerator Core Suffix
          NULL
           
      • Component Denominator
        NULL
         
        • Component Denominator Core
          NULL
           
        • Component Denominator Core Suffix
          NULL
           
    • Challenge
      NULL
       
    • Adjustment
      NULL
       
    • Count
      NULL
       
  • Property
    PrThr
    LP217195-9
  • Time
    Pt
    LP6960-1
  • System
    Isolate
    LP7370-2
    • System Core
      Isolate
      LP7370-2
    • Super System
      NULL
       
  • Scale
    Ord
    LP7751-3
  • Method
    Probe.amp.tar
    LP6464-4

Example Answer List: LL360-9

Source: Regenstrief Institute
AnswerCodeScoreAnswer ID
PositiveCopyright http://snomed.info/sct ID:10828004 Positive (qualifier value)LA6576-8
NegativeCopyright http://snomed.info/sct ID:260385009 Negative (qualifier value)LA6577-6

Basic Attributes

Class
MICRO
Type
Laboratory
First Released
Version 2.63
Last Updated
Version 2.63 (ADD)
Order vs. Observation
Both

Language Variants Get Info

TagLanguageTranslation
cs-CZCzech (Czechia)Escherichia coli enteroagregativní gen astA:Přítomnost nebo práh:Časový bod:Izolát:Ordinální:Amplifikace nukleových kyselin s detekcí sondou
de-DEGerman (Germany)Escherichia coli enteroaggregativ astA-Gen:Nachweis oder Schwellenwert:Zeitpunkt:Isolat:Ordinal:Zielfragmentamplifikation mit Sondendetektion
el-GRGreek (Greece)Εντεροσυναθριστικό γονίδιο astA Escherichia coli (Κολοβακτηρίδιο):PrThr:Pt:Απομονωμένο στέλεχος:Ord:Ανιχνευτής.ενίσχυση.στόχου
Synonyms: Escherichia coli (Κολοβακτηρίδιο) MICRO Ord PrThr Pt Ανιχνευτής Ανιχνευτής.ενίσχυση Ανιχνευτής.ενίσχυση.στόχου Απομονωμένο στέλεχος Γονίδιο Εντεροσυναθριστικό Escherichia coli (Κολοβακτηρίδιο) Εντεροσυναθριστικό γονίδιο astA Escherichia coli (Κολοβακτηρίδιο)
es-ESSpanish (Spain)Gen astA Escherichia coli enteroagregativo:PrThr:Punto temporal:Aislado:Ord:Sonda con amplificación dirigida
es-MXSpanish (Mexico)Gen astA enteroagregativo de Escherichia coli:Presencia o umbral:Punto temporal:Aislado:Ordinal:Amplificación de ácidos nucleicos con detección de sonda
fr-FRFrench (France)Escherichia coli entéro-agrégatif gène astA:Présence/Seuil:Ponctuel:Isolat:Qualitatif:PCR amplification de cible
it-ITItalian (Italy)Escherichia coli enteroaggregativi gene astA:PrThr:Pt:Isolato:Ord:Sonda.amp.tar
Synonyms: EAEC Microbiologia Presenza o Soglia Punto nel tempo (episodio) Sonda con amplificazione Sonda con amplificazione del target Sonda di DNA
nl-NLDutch (Netherlands)Escherichia coli aidA-I-gen:aanwezigheid:moment:isolaat:ordinaal:probe-detectie
Synonyms: E.coli; EAEC probe.amp.tar
pl-PLPolish (Poland)Enteroagregacyjna Escherichia coli astA gen:granica wykrywalności:punkt w czasie:izolat:uporządkowany:sonda.amplifikacja.cel
Synonyms: amplifikacja kwasu nukleinowego z detekcją za pomocą sondy amplifikacja z detekcją za pomocą sondy Gen astA enteroagregacyjnych szczepów Escherichia coli (EAEC)
zh-CNChinese (China)大肠埃希菌肠集聚型 astA 基因:存在情况或阈值:时间点:分离株:序数型:探针法.基因扩增.靶向
Synonyms: E coli;大肠埃希氏杆菌;大肠埃希氏菌;大肠杆菌 依次型;分类顺序型;定性的;序数型（或称等级型）;性质上的;有序型;有序性分类应答;有序性分类结果;秩次型;等级型;筛查;顺序型 借助扩增的探针方法;借助扩增的探针法;探针法.扩增 借助靶向扩增的探针方法;借助靶向扩增的探针法;探针法.扩增.靶向 分离物;分离菌;分离菌株;隔离种群 大肠埃希菌（E coli、大肠埃希氏杆菌、大肠埃希氏菌、大肠杆菌）肠集聚型（肠聚集性、肠聚集型、肠凝聚型、肠集聚性、肠道集聚型） astA 基因 存在情况;存在;存在与否;是否存在;阈值;界值;界限;阀值;临界值;存在情况（存在、存在与否、是否存在）或阈值（界值、界限、阀值、临界值） 微生物学;微生物学试验;微生物学试验（培养、DNA、抗原及抗体） 扩增型 扩增性 时刻;随机;随意;瞬间 经过扩增的 肠聚集性大肠埃希菌（E coli、大肠埃希氏杆菌、大肠埃希氏菌、大肠杆菌）;EAEC 脱氧核糖核酸探针 遗传基因;遗传因子;吉恩;生物基因

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CodeSystem lookup
https://fhir.loinc.org/CodeSystem/$lookup?system=http://loinc.org&code=87319-0