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Part Description

LP269180-8   Fungal 18s rRNA gene
The fungal 18S rRNA gene is approximately 1900 base pairs. It contains eight variable regions (V1-5 and V7-9) as well as one highly conserved region (V6). The highly conserved region can be used in molecular assays to detect the presence of fungal pathogens, and the variable regions can be used to identify specific species as well as for phylogenetic analysis. PMID: 2903154 Source: Regenstrief LOINC

LOINC Names Get Info

Fully-Specified Name
Fungal 18S rRNA gene:PrThr:Pt:Respiratory system specimen.lower:Ord:Probe.amp.tar
Long Common Name
Fungal 18s rRNA gene [Presence] in Lower respiratory specimen by NAA with probe detection
Short Name
Fungal 18s rRNA gene L. Resp Ql NAA+probe
Display Name
Fungal 18s rRNA gene NAA+probe Ql (Lower resp)
Consumer Name Alpha Get Info
Fungal 18s RRNA gene, Lower respiratory

Part Model Get Info

  • Component
    Fungal 18s rRNA gene
    LP269180-8
    • Analyte
      Fungal 18s rRNA gene
      LP269180-8
      • Component Numerator
        Fungal 18s rRNA gene
        LP269180-8
        • Component Numerator Core
          Fungal 18s rRNA gene
          LP269180-8
        • Component Numerator Core Suffix
          NULL
           
      • Component Denominator
        NULL
         
        • Component Denominator Core
          NULL
           
        • Component Denominator Core Suffix
          NULL
           
    • Challenge
      NULL
       
    • Adjustment
      NULL
       
    • Count
      NULL
       
  • Property
    PrThr
    LP217195-9
  • Time
    Pt
    LP6960-1
  • System
    Respiratory system specimen.lower
    LP438102-8
    • System Core
      Respiratory system specimen.lower
      LP438102-8
    • Super System
      NULL
       
  • Scale
    Ord
    LP7751-3
  • Method
    Probe.amp.tar
    LP6464-4

Example Answer List: LL744-4

Source: Regenstrief Institute
AnswerCodeScoreAnswer ID
DetectedLA11882-0
Not detectedLA11883-8

Basic Attributes

Class
MICRO
Type
Laboratory
First Released
Version 2.65
Last Updated
Version 2.77 (MAJ)
Change Reason
Release 2.77: SYSTEM: Updated to standardize the representation of "Respiratory system specimen" in the System subhierarchy across LOINC;
Order vs. Observation
Both

Member of these Panels

LOINCLong Common Name
94393-6Respiratory pathogens DNA and RNA panel - Lower respiratory specimen by NAA with probe detection

Language Variants Get Info

TagLanguageTranslation
cs-CZCzech (Czechia)Houby gen 18s rRNA:Přítomnost nebo práh:Časový bod:Vzorek dolních cest dýchacích:Ordinální:Amplifikace nukleových kyselin s detekcí sondou
el-GRGreek (Greece)Μυκητιακό γονίδιο 18s rRNA:PrThr:Pt:Δείγμα αναπνευστικού συστήματος.κατώτερο:Ord:Ανιχνευτής.ενίσχυση.στόχου
Synonyms: MICRO Ord PrThr Pt Αναπνευστικό Αναπνευστικό σύστημα Ανιχνευτής Ανιχνευτής.ενίσχυση Ανιχνευτής.ενίσχυση.στόχου Γονίδιο Δείγμα Δείγμα αναπνευστικού συστήματος Δείγμα αναπνευστικού συστήματος.κατώτερο Μυκητιακό γονίδιο 18s rRNA
es-MXSpanish (Mexico)Gen de ARNr 18s fúngico:Presencia o umbral:Punto temporal:Muestra de vías respiratorias inferiores:Ordinal:Amplificación de ácidos nucleicos con detección de sonda
es-ESSpanish (Spain)Gen RNA 18s fúngico:PrThr:Punto temporal:Muestra de vías respiratorias inferiores:Ord:Sonda con amplificación dirigida
Synonyms: Muestra del tracto respiratorio Muestra respiratoria Tracto respiratorio
fr-FRFrench (France)Champignon ARNr gène 18S:Présence/Seuil:Ponctuel:Échantillon du système respiratoire inférieur:Qualitatif:PCR amplification de cible
it-ITItalian (Italy)Fungino, gene 18s rRNA:PrThr:Pt:Campione da Sistema Respiratorio.inferiore:Ord:Sonda.amp.tar
Synonyms: Campione da Apparato Respiratorio Campione da apparato respiratorio inferiore Gene 18s rRNA fungino Microbiologia Presenza o Soglia Punto nel tempo (episodio) Sonda con amplificazione Sonda con amplificazione del target Sonda di DNA
nl-NLDutch (Netherlands)fungaal 18s rRNA-gen:aanwezigheid:moment:onderste luchtwegen:ordinaal:probe-detectie
Synonyms: onderste ademhalingsstelsel; systema respiratorium inferior probe.amp.tar systema respiratorium; ademhalingsstelsel
pl-PLPolish (Poland)Gen 18s rRNA u grzybów:granica wykrywalności:punkt w czasie:próbka z układu oddechowego.dolna część:uporządkowany:sonda.amplifikacja.cel
Synonyms: amplifikacja kwasu nukleinowego z detekcją za pomocą sondy amplifikacja z detekcją za pomocą sondy próbka z dolnych dróg układu oddechowego
zh-CNChinese (China)真菌 18s rRNA 基因:存在情况或阈值:时间点:呼吸系统标本.下:序数型:探针法.基因扩增.靶向
Synonyms: Gen-Probe rRNA 探针法.扩增.靶向 下 下的 下部 低级 低级的 供检查用的材料;待检物;待试验物;样品;样本;试料;试样 依次型;分类顺序型;定性的;序数型（或称等级型）;性质上的;有序型;有序性分类应答;有序性分类结果;秩次型;等级型;筛查;顺序型 借助扩增的探针方法;借助扩增的探针法;探针法.扩增 借助靶向扩增的探针方法;借助靶向扩增的探针法;探针法.扩增.靶向 受检物 呼吸系统（呼吸道）标本.下;下呼吸系统标本;下呼吸道标本 呼吸道标本（样品、样本）;呼吸系统标本（样品、样本） 基因探针 存在情况;存在;存在与否;是否存在;阈值;界值;界限;阀值;临界值;存在情况（存在、存在与否、是否存在）或阈值（界值、界限、阀值、临界值） 微生物学;微生物学试验;微生物学试验（培养、DNA、抗原及抗体） 扩增型 扩增性 时刻;随机;随意;瞬间 样品 样本 核糖体 RNA 探针法.基因扩增.靶向 核糖体 RNA 探针法.扩增.靶向 核糖体核糖核酸 探针法.基因扩增.靶向 核糖体核糖核酸 探针法.扩增.靶向 核蛋白体 RNA 核蛋白体 RNA 探针法.基因扩增.靶向 核蛋白体 RNA 探针法.扩增.靶向 核蛋白体 RNA（Ribosomal RNA，RRNA） 核蛋白体核糖核酸 核醣体 RNA 经过扩增的 脱氧核糖核酸探针 试样 较低 较低的 遗传基因;遗传因子;吉恩;生物基因

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CodeSystem lookup
https://fhir.loinc.org/CodeSystem/$lookup?system=http://loinc.org&code=91085-1